1、分子量小：纳米抗体是目前已知最小的功能性抗原结合片段，其分子量仅为15kD；其晶体直径仅为2.5 nm，长4 nm，因此组织穿透力强，甚至可以穿过血脑屏障，作为成像分子时在体内成像能够快速到达靶点，并迅速被肾脏代谢。

2、制备周期短：传统的通过细胞融合制备单克隆抗体周期长约6个月，而通过噬菌体展示技术能够绕开细胞的融合，更加快速的制备单克隆单体。

3、高稳定性：纳米抗体比传统抗体具有更高的稳定性，能耐受更加恶劣的条件，研究证实，将VHH抗体在37℃放置一周或在高温条件(90 ℃)下保存，它都能保持比较好的生物活性，因此纳米抗体比传统抗体更易储藏和运输，有些纳米抗体甚至可以通过消化道继续存活。

4、免疫原性弱：VHH抗体与人抗体的重链可变区具有超过80%的序列同源性，并且二者的3D结构可以重合，因此人源化简单。另外，VHH的稳定性高而不容易聚集，从而避免了由蛋白质聚集导致的免疫原性增强的问题。

5、高抗原结合性：纳米抗体能到达传统抗体无法达到的表位，由于其长的CDR3区，能够伸入到酶的活性中性，细菌或病毒表面受体的裂缝中，甚至可以有效的穿过血脑屏障，这使得纳米抗体有望成为治疗老年痴呆症的新药。

6、易表达，易纯化：由于scFv中的VL和VH经常发生错配，导致scFv多以包涵体形式表达。而VHH仅由单个结构域组成，不存在结构域错配的问题；而且VHH的溶解性较好，因此很容易实现可溶性表达。

7、易于构建构建多价和多功能抗体：普通抗体分子太大，不适于构建多价或多功能抗体；利用scFv抗体构建多价或多功能抗体时，常因为VH和VL结构域错配而导致聚集或亲和力下降，并且表达水平低且易被降解。VHH具有严格的单结构域特性、高水溶性和高稳定性等优点，十分适合构建多价或多功能抗体。